مديريت طرح و برنامه يکي از واحدهاي کليدي و پر مسئوليت بوده و نقش موثري در کارآمدي و پويائي سازمان مجري طرح دارد . مديريت طرح و برنامه از سه بخش آمار و برنامه ريزي ،توسعه فناوري اطلاعات و برنامه و بودجه تشكيل شده است.

واحد برنامه وبودجه عمدتا نقش تهيه،تنظيم وكنترل اجرای برنامه های کوتاه، میان مدت و بلند مدت كل طرح و تدوين بودجه سالانه طرح را بر عهده دارد. يكي ديگر از وظايف مهم این واحد را می توان تهیه، گردآوری و بازتدوين گزارشات ارزيابي اقتصادي پروژه ها و در نهايت تجزيه و تحلیل آنها وهم چنين تهیه گزارشات ماهانه و سالیانه جهت ارائه به مدیریت  به شمار آورد. برنامه ریزی و کنترل پروژه ها و هدایت آنها مطابق برنامه زمان بندی نيز از دیگر فعالیتهای این واحد می باشد. بررسی و مطالعه قراردادهای منعقده با پیمانکاران داخلی و خارجی به منظور آگاهی از مفاد قرارداد و ملحوظ داشتن مفاد آن در تهیه و تدوین برنامه ها از ديگر اقدامات مهم این واحد است.

 در واحد توسعه فناوري اطلاعات توليد، توسعه و پشتيباني سيستم هاي GIS-MIS و ساير سيستم هاي نرم افزاري مبتني بر آخرين متدها و استاندردهاي روز درحال اجرا مي باشد.

 واحد آمار و برنامه ريزي وظيفه پيگيري و ارسال اطلاعات در خصوص بودجه عملياتي، موافقتنامه هاي عمراني ، شاخص هاي وضع شده و ساير اطلاعات آماري-آموزشي، مديريتي و سيستمي را بر عهده دارد. هم چنين پيگيري امور مربوط به استقرار و نگهداري سيستم مديريت كيفيت منطقه و كنترل و نظارت بر نرم افزار آماري ثبت عملكرد (سامانه سبا) از ديگر وظايف عمده اين واحد مي باشد.